Lorsqu’un salarié est en arrêt de travail des indemnités journalières de la sécurité sociale viennent en principe compenser la perte de salaire. On parle d’IJSS.
Le salarié licencié à la suite d’un arrêt maladie (inaptitude avec impossibilité de reclassement par exemple) bénéficie d’indemnité de licenciement calculé suivant les dispositions légales à défaut de dispositions conventionnelles.